Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM28Q9NW13 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM28Q9NW13 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms