Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNNM1Q9NRU3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNNM1Q9NRU3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms