Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX15Q9NRS6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms