Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RPRD1BQ9NQG5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RPRD1BQ9NQG5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms