Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRC4Q9NPP4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NLRC4Q9NPP4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms