Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLCO1B3Q9NPD5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLCO1B3Q9NPD5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms