Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PNPLA8Q9NP80 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PNPLA8Q9NP80 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms