Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZCCHC17Q9NP64 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms