Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARFGAP3Q9NP61 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARFGAP3Q9NP61 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms