Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CLSPNQ9HAW4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLSPNQ9HAW4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms