Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPAP3Q9H6T3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms