Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIL1Q9H173 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIL1Q9H173 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms