Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BHLHE41Q9C0J9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms