Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCSER1Q9C0I3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCSER1Q9C0I3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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