Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2OQ9C0C9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2OQ9C0C9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms