Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
AMBRA1Q9C0C7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms