Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM4Q9C037 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM4Q9C037 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms