Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDEM3Q9BZQ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms