Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYU5

KRTAP2-1, Keratin-associated protein 2-1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-1Q9BYU5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KRTAP2-1Q9BYU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms