Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIFKQ9BYG3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIFKQ9BYG3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms