Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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