Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SYCP2Q9BX26 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
SYCP2Q9BX26 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SYCP2Q9BX26 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms