Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RBM42Q9BTD8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RBM42Q9BTD8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms