Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms