Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MESP1Q9BRJ9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms