Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC77Q9BR77 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms