Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LPIN3Q9BQK8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms