Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MYD88Q99836 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MYD88Q99836 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms