Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MTRQ99707 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRQ99707 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRQ99707 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRQ99707 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTRQ99707 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRQ99707 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms