Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSRNP1Q96S65 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSRNP1Q96S65 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms