Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRAM1Q96QH2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms