Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCNAQ96QF7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms