Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC4A9Q96Q91 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC4A9Q96Q91 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms