Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ALS2CR12Q96Q35 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ALS2CR12Q96Q35 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms