Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC85AQ96PX6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC85AQ96PX6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms