Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RUNDC3BQ96NL0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms