Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGCZQ96LD1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGCZQ96LD1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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