Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EP400Q96L91 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EP400Q96L91 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms