Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPNS2Q96L46 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPNS2Q96L46 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms