Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PDLIM2Q96JY6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDLIM2Q96JY6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms