Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LOXL4Q96JB6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LOXL4Q96JB6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms