Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
COG3Q96JB2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COG3Q96JB2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms