Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC34Q96HJ3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms