Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMTM5Q96DZ9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMTM5Q96DZ9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms