Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCAMP4Q969E2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCAMP4Q969E2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms