Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms