Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRPF31Q8WWY3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms