Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC12Q8WUD4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC12Q8WUD4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms