Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-3Q8TAU0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-3Q8TAU0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms