Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND83

SLAIN1, SLAIN motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN1Q8ND83 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms